Protein bar makinesinin çalışma prensibi esas olarak hammadde işleme, ekstrüzyon kalıplama, soğutma, kesme ve kaplama adımlarını içerir. Birincisi, soya proteini, tatlandırıcılar, pigmentler ve meyve aromaları gibi hammaddeler belirli bir oranda karıştırılır ve düzgün bir temel karışım oluşturmak için karıştırmak ve karıştırmak için uygun miktarda su eklenir. Daha sonra, karışım, protein çubuğu makinesinin temel işlem adımı olan ekstrüzyon kalıplama için ekstrüdere gönderilir. Ekstrüder boşluğunda, hammaddeler ekstrüde edilir ve protein çubuğunun şeklini ve basıncını oluşturmak için döndürülür, bu da nihai ürünün iyi bir tada ve kalite stabilitesine sahip olmasını sağlar.
Oluşturulan protein çubuğunun, şurup ve içindeki diğer maddelerin tamamen katılaşmasını ve yeterli sertlik sağlamasını sağlamak için bir soğutma tünelinden katılaştırılması gerekir. Soğutulmuş protein çubuğu daha sonra bir kesme cihazı ile düzgün dikdörtgen şeritler halinde kesilir. Son olarak, kesilmiş protein çubuğu kaplama ekipmanından geçer ve yüzey nihai ürünü oluşturmak için bir çikolata veya başka bir kaplama tabakası ile kaplanır.